Eduardo Saverin sinh tại Sao Paulo, Brasil trong một gia đình Do Thái Brasil giàu có[6][7][8] và lớn lên tại Miami, Florida, Hoa Kỳ. Cha của anh là một nhà tư bản công nghiệp làm việc trong ngành xuất khẩu, quần áo, hàng hải và kinh doanh bất động sản.[9]

Anh học tại trường Gulliver Preparatory tại Miami, sau đó học đại học tại trường đại học Harvard, nơi Eduardo là thành viên của câu lạc bộ Phoenix S.K, và là chủ tịch của Hiệp hội đầu tư Harvard. Trong suốt thời gian học tại Harvard, anh kiếm được 300 000 đô-la Mỹ bởi những cuộc đầu tư chiến lược trong ngành công nghiệp dầu khí.[10] Vào năm 2006, anh tốt nghiệp magna cum laude từ trường đại học Harvard với bằng cử nhân kinh tế. Người ta cho rằng anh đang sống tại Singapore.[11]